Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a1Q05722 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms