Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms