Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms