Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms