Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms