Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms