Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms