Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms