Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gfra1P97785 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms