Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cited1P97769 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms