Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabpb2P81069 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms