Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms