Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxb13P70321 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxb13P70321 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxb13P70321 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb13P70321 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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