Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ElobP62869 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms