Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps13P62301 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms