Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps11P62281 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps11P62281 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms