Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms