Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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