Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms