Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms