Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms