Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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