Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbrP50284 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms