Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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