Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtshP49935 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtshP49935 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtshP49935 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtshP49935 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtshP49935 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtshP49935 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtshP49935 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtshP49935 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtshP49935 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms