Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brca1P48754 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brca1P48754 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brca1P48754 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brca1P48754 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Brca1P48754 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brca1P48754 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brca1P48754 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brca1P48754 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brca1P48754 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brca1P48754 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brca1P48754 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms