Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms