Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms