Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Timp3P39876 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms