Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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TtlP38585 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TtlP38585 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TtlP38585 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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TtlP38585 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms