Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprkP35822 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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