Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms