Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5cP35278 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab5cP35278 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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