Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms