Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprmP28828 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprmP28828 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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