Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde6aP27664 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde6aP27664 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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