Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms