Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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