Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PparaP23204 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms