Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms