Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NefhP19246 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NefhP19246 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NefhP19246 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NefhP19246 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms