Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18530 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18530 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18530 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms