Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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