Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou4f1P17208 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms