Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcna1P16388 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms