Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms