Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms