Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtaP09225 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtaP09225 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtaP09225 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtaP09225 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtaP09225 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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