Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04944 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04944 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04944 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04944 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04944 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04944 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04944 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04944 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms