Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01820 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01820 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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